مطالعه فیلوژنتیکی ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سال های 2006-2003

زمینه و اهداف: ساب تایپ H5N1 ویروس انفلوآنزا، که با قدرت کشندگی بالا می باشد، در سال‌های اخیر باعث تلفات زیادی در منطقه آسیا و به‌ویژه در کشورهای آسیای شرقی و خاور میانه شده‌است. هدف این مطالعه تعیین فیلوژنتیک ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سال‌‌های 2006-2003 بود. روش بررسی: از الگوریتم‌های بیوانفورماتیکی همترازی سکانس‌ها استفاده شد. سکانس‌های ژنی و پروتئینی ژن هماگلوتینین ساب تایپ H5N1 ویروس انفلوآنزا که در بانک‌های ژنی و پروتئینی کشور‌های همسایه ایران گزارش شده بود، استخراج شد و مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافته ها: بین سال‌های 2006-2003، از بروز عفونت انفلوآنزا ساب تایپ H5N1 در کشورهای همسایه ایران 237 گزارش به بانک ژنوم (GenBank) گزارش شده بود. پس از بررسی 64 مورد سکانس غیر تکراری استخراج شد. در نهایت 64 سکانس ژن و پروتئین هماگلوتینین با استفاده از الگوریتم بیوانفورماتیکی Clustal و نرم افزارهای clustalW و MEGA4 سکانس ژنومی و اسیدآمینه بررسی و تجزیه و تحلیل شد. سرانجام درخت فیلوژنتیکی این ویروس‌ها تعیین گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی ژن هماگلوتینین نشان داد که این ویروس از مرز‌های شمالی کشور به‌ویژه روسیه و کشور‌های تازه استقلال یافته آسیای میانه وارد ایران شده است. سپس از منطقه شمالی در داخل کشور گسترش یافته است. نتیجه گیری: ویروس انفلوانزای نوع H1N1 از طریق کشورهای همسایه شمالی وارد کشور ایران شده‌است.